MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 40548

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017045	GAC	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484661
2	NC_017045	TGA	2	6	123	128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
3	NC_017045	TAT	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484661
4	NC_017045	A	8	8	226	233	100 %	0 %	0 %	0 %	383484661
5	NC_017045	A	6	6	259	264	100 %	0 %	0 %	0 %	383484661
6	NC_017045	GTGA	2	8	322	329	25 %	25 %	50 %	0 %	383484661
7	NC_017045	TAT	2	6	334	339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484661
8	NC_017045	GGT	2	6	424	429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484661
9	NC_017045	ATG	2	6	485	490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
10	NC_017045	ATG	2	6	494	499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
11	NC_017045	TGT	2	6	507	512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484661
12	NC_017045	ATG	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
13	NC_017045	GAT	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
14	NC_017045	ATG	2	6	715	720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
15	NC_017045	ATGG	2	8	724	731	25 %	25 %	50 %	0 %	383484661
16	NC_017045	CAA	2	6	766	771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484661
17	NC_017045	A	6	6	823	828	100 %	0 %	0 %	0 %	383484661
18	NC_017045	TG	3	6	984	989	0 %	50 %	50 %	0 %	383484661
19	NC_017045	TGCT	2	8	1007	1014	0 %	50 %	25 %	25 %	383484661
20	NC_017045	A	6	6	1036	1041	100 %	0 %	0 %	0 %	383484661
21	NC_017045	ACA	2	6	1067	1072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484661
22	NC_017045	GAT	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
23	NC_017045	T	6	6	1225	1230	0 %	100 %	0 %	0 %	383484661
24	NC_017045	ATG	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
25	NC_017045	TTG	2	6	1306	1311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484661
26	NC_017045	A	6	6	1318	1323	100 %	0 %	0 %	0 %	383484661
27	NC_017045	A	6	6	1333	1338	100 %	0 %	0 %	0 %	383484661
28	NC_017045	CAA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484661
29	NC_017045	ATG	2	6	1400	1405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484661
30	NC_017045	GAAACA	2	12	1483	1494	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383484661
31	NC_017045	CA	3	6	1493	1498	50 %	0 %	0 %	50 %	383484661
32	NC_017045	A	7	7	1580	1586	100 %	0 %	0 %	0 %	383484661
33	NC_017045	AGTTT	2	10	1625	1634	20 %	60 %	20 %	0 %	383484661
34	NC_017045	ACAG	2	8	1768	1775	50 %	0 %	25 %	25 %	383484661
35	NC_017045	AT	3	6	1779	1784	50 %	50 %	0 %	0 %	383484661
36	NC_017045	ATT	2	6	1874	1879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484661
37	NC_017045	AAAG	2	8	2305	2312	75 %	0 %	25 %	0 %	383484662
38	NC_017045	TTG	2	6	2331	2336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484662
39	NC_017045	TGG	2	6	2417	2422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484662
40	NC_017045	T	6	6	2444	2449	0 %	100 %	0 %	0 %	383484662
41	NC_017045	GTT	2	6	2466	2471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484662
42	NC_017045	A	8	8	2488	2495	100 %	0 %	0 %	0 %	383484662
43	NC_017045	A	6	6	2500	2505	100 %	0 %	0 %	0 %	383484662
44	NC_017045	A	6	6	2510	2515	100 %	0 %	0 %	0 %	383484662
45	NC_017045	AATAAA	2	12	2531	2542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383484662
46	NC_017045	GAAA	2	8	2559	2566	75 %	0 %	25 %	0 %	383484662
47	NC_017045	AATA	2	8	2599	2606	75 %	25 %	0 %	0 %	383484663
48	NC_017045	AAAG	2	8	2623	2630	75 %	0 %	25 %	0 %	383484663
49	NC_017045	GGA	2	6	2679	2684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383484663
50	NC_017045	AAG	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484663
51	NC_017045	AAT	2	6	2767	2772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484663
52	NC_017045	TGA	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484663
53	NC_017045	ATT	2	6	2806	2811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484663
54	NC_017045	ACTT	2	8	2838	2845	25 %	50 %	0 %	25 %	383484663
55	NC_017045	GAA	2	6	3085	3090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484664
56	NC_017045	CAA	2	6	3269	3274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484664
57	NC_017045	ACA	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484664
58	NC_017045	A	8	8	3293	3300	100 %	0 %	0 %	0 %	383484664
59	NC_017045	CTTTTT	2	12	3327	3338	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383484664
60	NC_017045	TGG	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484664
61	NC_017045	A	6	6	3465	3470	100 %	0 %	0 %	0 %	383484664
62	NC_017045	TTG	2	6	3545	3550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484664
63	NC_017045	ATT	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484664
64	NC_017045	A	6	6	3638	3643	100 %	0 %	0 %	0 %	383484664
65	NC_017045	AAG	2	6	3653	3658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484664
66	NC_017045	GCAA	2	8	3666	3673	50 %	0 %	25 %	25 %	383484664
67	NC_017045	GAC	2	6	3836	3841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484664
68	NC_017045	A	6	6	4330	4335	100 %	0 %	0 %	0 %	383484665
69	NC_017045	AAG	2	6	4359	4364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484665
70	NC_017045	A	6	6	4379	4384	100 %	0 %	0 %	0 %	383484665
71	NC_017045	CAA	2	6	4454	4459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484665
72	NC_017045	AAG	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484665
73	NC_017045	ATA	2	6	4546	4551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484665
74	NC_017045	ATCAA	2	10	4569	4578	60 %	20 %	0 %	20 %	383484665
75	NC_017045	T	6	6	4600	4605	0 %	100 %	0 %	0 %	383484665
76	NC_017045	TGA	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484665
77	NC_017045	CAA	2	6	4868	4873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484665
78	NC_017045	AG	3	6	4905	4910	50 %	0 %	50 %	0 %	383484665
79	NC_017045	TGT	2	6	4920	4925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484665
80	NC_017045	A	7	7	4956	4962	100 %	0 %	0 %	0 %	383484665
81	NC_017045	A	6	6	5012	5017	100 %	0 %	0 %	0 %	383484665
82	NC_017045	A	8	8	5036	5043	100 %	0 %	0 %	0 %	383484665
83	NC_017045	T	6	6	5365	5370	0 %	100 %	0 %	0 %	383484666
84	NC_017045	AGA	2	6	5385	5390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484666
85	NC_017045	TGA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484666
86	NC_017045	A	6	6	5420	5425	100 %	0 %	0 %	0 %	383484666
87	NC_017045	CAA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484666
88	NC_017045	A	6	6	5488	5493	100 %	0 %	0 %	0 %	383484666
89	NC_017045	CTT	2	6	5548	5553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383484666
90	NC_017045	AAAG	2	8	5613	5620	75 %	0 %	25 %	0 %	383484666
91	NC_017045	CAA	2	6	5633	5638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383484666
92	NC_017045	TAA	2	6	5682	5687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383484666
93	NC_017045	AT	3	6	5755	5760	50 %	50 %	0 %	0 %	383484667
94	NC_017045	TTG	2	6	5883	5888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484667
95	NC_017045	AGT	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383484667
96	NC_017045	GAA	2	6	6005	6010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484667
97	NC_017045	T	8	8	6258	6265	0 %	100 %	0 %	0 %	383484668
98	NC_017045	T	6	6	6272	6277	0 %	100 %	0 %	0 %	383484668
99	NC_017045	GAAA	2	8	6279	6286	75 %	0 %	25 %	0 %	383484668
100	NC_017045	A	6	6	6336	6341	100 %	0 %	0 %	0 %	383484668
101	NC_017045	ATT	2	6	6377	6382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484668
102	NC_017045	A	6	6	6394	6399	100 %	0 %	0 %	0 %	383484668
103	NC_017045	AATG	2	8	6544	6551	50 %	25 %	25 %	0 %	383484668
104	NC_017045	TTA	2	6	6616	6621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484668
105	NC_017045	GAA	2	6	6671	6676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484668
106	NC_017045	T	6	6	6696	6701	0 %	100 %	0 %	0 %	383484668
107	NC_017045	TAC	2	6	6775	6780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383484668
108	NC_017045	AAG	2	6	6783	6788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484668
109	NC_017045	TGAATT	2	12	6799	6810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383484668
110	NC_017045	AGA	2	6	6820	6825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484668
111	NC_017045	A	7	7	6842	6848	100 %	0 %	0 %	0 %	383484668
112	NC_017045	GAA	2	6	6866	6871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484668
113	NC_017045	AATA	2	8	6878	6885	75 %	25 %	0 %	0 %	383484668
114	NC_017045	ATT	2	6	7078	7083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484669
115	NC_017045	GAC	2	6	7085	7090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484669
116	NC_017045	TGG	2	6	7117	7122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383484669
117	NC_017045	CGACAA	2	12	7152	7163	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383484669
118	NC_017045	T	6	6	7242	7247	0 %	100 %	0 %	0 %	383484669
119	NC_017045	T	6	6	7308	7313	0 %	100 %	0 %	0 %	383484669
120	NC_017045	A	6	6	7359	7364	100 %	0 %	0 %	0 %	383484669
121	NC_017045	GAC	2	6	7415	7420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383484669
122	NC_017045	A	6	6	7510	7515	100 %	0 %	0 %	0 %	383484669
123	NC_017045	A	7	7	7826	7832	100 %	0 %	0 %	0 %	383484670
124	NC_017045	ATT	2	6	7834	7839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484670
125	NC_017045	AATG	2	8	7913	7920	50 %	25 %	25 %	0 %	383484670
126	NC_017045	TTA	2	6	7953	7958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383484670
127	NC_017045	GAA	2	6	7985	7990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484670
128	NC_017045	A	8	8	8016	8023	100 %	0 %	0 %	0 %	383484670
129	NC_017045	GTT	2	6	8026	8031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383484670
130	NC_017045	GAA	2	6	8048	8053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383484670
131	NC_017045	A	6	6	8052	8057	100 %	0 %	0 %	0 %	383484670
132	NC_017045	TGGT	2	8	8059	8066	0 %	50 %	50 %	0 %	383484670
133	NC_017045	AAAT	2	8	8071	8078	75 %	25 %	0 %	0 %	383484670
134	NC_017045	TGAC	2	8	8094	8101	25 %	25 %	25 %	25 %	383484670
135	NC_017045	AT	3	6	8133	8138	50 %	50 %	0 %	0 %	383484670
136	NC_017045	TA	3	6	8169	8174	50 %	50 %	0 %	0 %	383484670
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138	NC_017045	AAGT	2	8	8232	8239	50 %	25 %	25 %	0 %	383484670
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